Kościół w Pomorskiej Wsi erygowano w 1387 roku. Podczas reformacji we wsi powstała wspólnota protestancka, która funkcjonowała na tym obszarze aż do II drugiej wojny światowej. Na początku XIX w. wzniesiono obecny kościół pod wezwaniem Niepokalanego Serca Najświętszej Maryi Panny.
Po II wojnie światowej kościół przejęli katolicy.