Budowę Biskupina jako osiedla rozpoczeto w 1919 roku. Od 1928 roku w granicach Wrocławia. Urzędowa nazwa Biskupin funkcjonuje od 1948. Wcześniej - Kożuchów.

Pierwsza wzmianka z roku 1155 o wsi Cochtow jako własność biskupów wrocławskich. W XVIII w. wzmiankowana tylko jest karczma i cegielnia. w 1794 r. pobliski las łęgowy zwano Bischofswald. Na początku XIX w. założono folwark z ogrodem. w połowie XIX w. była już osada z 31 mieszkańcami. Znajdowała się tam popularna restauracja Schaffgotschgarten. Po regulacji koryta Odry na początku XX w., dawne tereny zalewowe przekształcono pod budowę nowego osiedla. Biskupin włączono do Wrocławia w 1928 r. i przedłużono linię tramwajową. W latach 30. powstało nowoczesne "zielone osiedle" o zabudowie willowej i blokowej. Biskupin ocalał ze zniszczeń wojennych 1945 r. We wschodniej części Biskupina w latach 60.-70. wzniesiono osiedle blokowe, a w południowej części domy studenckie i budynki UP i PWr. Nad Odrą znajdują się tereny rekreacyjne z parkiem Biskupińskim.